BSDBuild utilise des Makefiles conformes à la norme POSIX et génère des scripts configure Bourne. BSDBuild fut testé sur les systèmes d'exploitation suivants:

• FreeBSD (BSD make, GNU make)
• Irix 6.5 (GNU make)
• Linux (GNU make)
• MacOS X
• NetBSD (BSD make, GNU make)
• OpenBSD (BSD make, GNU make)
• Windows/MSYS (GNU make)
• Windows/Cygwin (GNU make)